0:00:00.710,0:00:02.579
Şu çizime bir bakın.

0:00:02.579,0:00:04.183
Ne olduğunu söyleyebilir misiniz?

0:00:04.183,0:00:06.930
Moleküler biyoloji eğitimi aldım

0:00:06.930,0:00:09.533
ve bunun gibi birçok çizim gördüm.

0:00:09.533,0:00:12.475
Bunlar genellikle örnek[br]çizim diye tabir edilir,

0:00:12.475,0:00:14.491
bir hücresel ya da moleküler işlemin

0:00:14.491,0:00:16.988
nasıl olduğunu düşündüğümüzü[br]gösteren bir çizim.

0:00:17.023,0:00:20.672
Bu çizim Klatrin bağımlı endositoz

0:00:20.672,0:00:23.845
denilen bir işlemi[br]ayrıntılı olarak gösteriyor.

0:00:23.845,0:00:26.455
Bu daha sonra hücre tarafından özümsenen

0:00:26.455,0:00:29.443
bir kese ya da kabarcık[br]vasıtasıyla bir molekülün

0:00:29.443,0:00:32.120
hücre dışından hücre içine

0:00:32.120,0:00:34.050
alınabildiği bir işlemdir.

0:00:34.050,0:00:35.885
Yine de, bu çizimde bir hata var,

0:00:35.885,0:00:38.517
ve esas olarak neyi[br]göstermediği ile ilgili.

0:00:38.517,0:00:39.982
Çok sayıda deneyden,

0:00:39.982,0:00:41.817
çok sayıda farklı bilim adamından,

0:00:41.817,0:00:44.813
bu moleküllerin nasıl göründüğü[br]ile ilgili bir çok şey biliyoruz.

0:00:44.813,0:00:46.495
Hücre içerisinde hareket edişlerini

0:00:46.495,0:00:48.320
ve tüm bunların

0:00:48.320,0:00:50.870
inanılmaz hareketli[br]bir ortamda meydana geldiğini.

0:00:51.310,0:00:54.783
Klathrin uzmanı[br]Tomas Kirchhausen'in işbirliği ile,

0:00:54.783,0:00:57.102
olayın tamamını gösteren[br]yeni bir örnek çizim çeşidi

0:00:57.102,0:00:59.126
yaratmaya karar verdik.

0:00:59.126,0:01:00.862
Böylece, hücre dışından başladık.

0:01:00.862,0:01:02.510
Şimdi içine bakıyoruz.

0:01:02.510,0:01:04.590
Klathrin şu üç bacaklı moleküldür

0:01:04.590,0:01:07.878
ki kendi kendini futbol topuna[br]benzer şekilde monte edebilir.

0:01:07.878,0:01:09.575
Bir zar ile birleşmesi sayesinde,

0:01:09.575,0:01:11.742
klathrin zarın şeklini bozabilir

0:01:11.742,0:01:13.155
ve bir balon ya da[br]kabarcık şeklini alarak

0:01:13.155,0:01:15.462
fincana benzer bir form oluşturur,

0:01:15.462,0:01:17.246
bu oluşum hücrenin dışındaki bazı

0:01:17.246,0:01:18.900
proteinleri hapsetmeye başlar.

0:01:18.900,0:01:22.398
Proteinler şimdi içeriden[br]kabarcığa çimdik atar

0:01:22.398,0:01:24.982
ve onu zarın kalanından ayırır.

0:01:24.982,0:01:27.374
Şimdi klathrin görevini[br]yerine getirmiş oldu

0:01:27.374,0:01:28.612
ve proteinler içeri gelmeye başladı.

0:01:28.612,0:01:30.558
Onları sarı ve turuncu ile belirttik.

0:01:30.558,0:01:33.100
Bunlar klathrin kafesini[br]ayrıştırmakla yükümlü.

0:01:33.100,0:01:36.382
Neticede bütün bu proteinler geri dönüşmüş

0:01:36.382,0:01:37.918
ve yeniden kullanılmış oldu.

0:01:37.918,0:01:41.327
Bu işlemler en iyi[br]mikroskoplarla bile direkt

0:01:41.327,0:01:43.159
olarak görülemeyecek kadar küçükler,

0:01:43.159,0:01:45.790
yani bu gibi animasyonlar bir hipotezi

0:01:45.790,0:01:48.808
görselleştirmeyi güçlü[br]bir şekilde sağlıyor.

0:01:48.808,0:01:50.654
İşte başka bir çizim

0:01:50.654,0:01:53.390
ve bu da bir araştırmacının[br]HIV virüsünün hücreye

0:01:53.390,0:01:56.895
nasıl girip çıktığını düşündüğünün çizimi.

0:01:56.895,0:01:59.414
Ve yine, bu çok büyük bir basitleştirme

0:01:59.414,0:02:01.158
ve bu işlemler hakkında gerçekten

0:02:01.158,0:02:03.640
bildiklerimizi göstermeye başlamyor.

0:02:03.640,0:02:05.855
Bu çizimlerin çoğu biyoloğun moleküler

0:02:05.855,0:02:08.622
hipotezlerini görselleştirmek[br]için kullandığı

0:02:08.622,0:02:12.454
tek yol olduğuna şaşırıyor olabilirsiniz.

0:02:12.454,0:02:13.482
Niçin?

0:02:13.482,0:02:15.472
Çünkü işlemlerin oluş[br]şekillerini düşündüğümüze

0:02:15.472,0:02:18.486
en yakın haliyle gösteren filmler[br]yaratmak gerçekten çok zor.

0:02:18.486,0:02:22.119
Hollywood'da 3D animasyon yazılımı[br]öğrenmek için aylar geçirdim

0:02:22.119,0:02:24.400
ve her bir animasyon[br]için de aylar harcadım

0:02:24.400,0:02:27.750
ve bu çoğu araştırmacının[br]karşılayamayacağı bir zaman.

0:02:27.750,0:02:29.950
Gerçi bedeli muazzam olabiliyor.

0:02:29.950,0:02:32.334
Moleküler animasyonlar geniş kitlelere

0:02:32.334,0:02:35.775
üstün kesinlikte bilgiyi yayma

0:02:35.775,0:02:39.367
becerileriyle benzersizdir.

0:02:39.367,0:02:40.870
Şu anda "HIV'nin Bilimi" adlı

0:02:40.870,0:02:42.308
bir proje üzerine çalışıyorum.

0:02:42.308,0:02:44.670
Burada HIV virüsünün tüm yaşam döngüsünü

0:02:44.670,0:02:47.774
olabilecek en kati şekilde ve tüm

0:02:47.774,0:02:49.735
moleküler detaylarıyla canlandıracağım.

0:02:49.735,0:02:51.886
Bu animasyon binlerce araştırmacının

0:02:51.886,0:02:54.862
yüzyıllar boyunca[br]biriktirdiği verileri içerecek.

0:02:54.862,0:02:57.942
Bunlar virüsün neye benzediğini,[br]

0:02:57.942,0:03:01.030
vücudumuzdaki hücrelere[br]nasıl bulaşabildiğini

0:03:01.030,0:03:04.622
ve iyileştiricilerin enfeksiyonla nasıl[br]mücadele ettiğini gösteren veriler.

0:03:05.002,0:03:07.331
Yıllar boyunca, gördüm ki animasyonlar

0:03:07.331,0:03:10.150
sadece bir fikri anlatmakta değil

0:03:10.150,0:03:11.646
aynı zamanda bir hipotezi

0:03:11.646,0:03:13.958
keşfetmek için de gerçekten faydalı.

0:03:13.958,0:03:17.152
Biyologlar hâlâ araştırdıkları[br]işlemleri görselleştirmek için

0:03:17.152,0:03:19.374
çoğunlukla kalem ve kağıt kullanıyorlar

0:03:19.374,0:03:22.854
ve şu anda sahip olduğumuz[br]verilerle bu artık yeterince iyi değil.

0:03:22.854,0:03:25.270
Bir animasyon yaratma işlemi,

0:03:25.270,0:03:27.927
araştırmacılara kendi[br]fikirlerini açığa çıkartmaları

0:03:27.927,0:03:30.878
ve ayıklamaları için bir[br]katalizör gibi davranabilir.

0:03:30.878,0:03:32.662
Çalıştığım araştırmacılardan birisi

0:03:32.662,0:03:34.438
sinir dokusu bozulumunun moleküler

0:03:34.438,0:03:36.222
mekanizmaları üzerine çalışıyordu,

0:03:36.222,0:03:38.200
birlikte çalıştığımız[br]animasyonla direkt olarak

0:03:38.200,0:03:41.183
alakalı olan deneylerle[br]çıkageldi ve böylece

0:03:41.183,0:03:45.304
animasyon araştırma[br]sürecine geri besleme yapabildi.

0:03:45.304,0:03:48.157
İnanıyorum ki animasyon[br]biyolojiyi değiştirebilir.

0:03:48.157,0:03:50.725
Bu bizim birbirimizle iletişim şeklimizi,

0:03:50.725,0:03:52.348
verileri nasıl incelediğimizi[br]ve öğrencilerimizi

0:03:52.348,0:03:53.675
nasıl eğittiğimizi değiştirebilir.

0:03:53.675,0:03:55.129
Ama bu değişim için

0:03:55.129,0:03:58.286
animasyon yapan daha fazla[br]araştırmacıya ihtiyacımız var

0:03:58.286,0:04:00.541
ve bu doğrultuda yeni, ücretsiz,

0:04:00.541,0:04:03.678
açık kaynaklı bir yazılım yaratmak için

0:04:03.678,0:04:06.725
animatör ve programcılardan[br]oluşan bir ekip topladım.

0:04:06.725,0:04:08.629
Buna "Moleküler Kitap" dedik

0:04:08.629,0:04:10.525
ve bu yalnızca biyologların moleküler

0:04:10.525,0:04:13.570
animasyonlar yaratmaları için yapıldı.

0:04:14.070,0:04:17.782
Testlerimizde daha önce animasyon deneyimi

0:04:17.782,0:04:21.050
olmayan bir biyoloğun[br]hipotezi için yapacağı

0:04:21.050,0:04:23.786
ilk moleküler animasyonunu sadece

0:04:23.786,0:04:25.308
15 dakikada bitirdiğini gördük.

0:04:25.308,0:04:27.458
Ayrıca herkesin kendi animasyonunu

0:04:27.458,0:04:30.233
görüntüleyebileceği, indirebileceği[br]ve katkıda bulunabileceği

0:04:30.233,0:04:31.849
bir veritabanı yapıyoruz.

0:04:31.849,0:04:33.820
Bu yazılımın beta versiyonun bugünden

0:04:33.820,0:04:36.282
itibaren indirilmeye hazır olduğunu

0:04:36.282,0:04:40.490
duyurmaktan büyük mutluluk duyuyoruz.

0:04:40.490,0:04:43.233
Biyologların onunla[br]neler yaratabileceklerini,

0:04:43.233,0:04:45.289
kendi animasyonlarını yaratırken

0:04:45.289,0:04:46.770
elde edecekleri yeni içgörüleri

0:04:46.770,0:04:48.473
görebileceğimiz için heyecanlıyız.

0:04:48.473,0:04:50.713
Teşekkürler.

0:04:50.713,0:04:53.871
(Alkışlar)